Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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