Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms