Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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