Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn3aA2ASI5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Scn3aA2ASI5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Scn3aA2ASI5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms