Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SktA2AQ25 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms