Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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