Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms