Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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