Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn9Q9Z0S7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms