Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cldn13Q9Z0S4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn13Q9Z0S4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn13Q9Z0S4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn13Q9Z0S4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn13Q9Z0S4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn13Q9Z0S4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn13Q9Z0S4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn13Q9Z0S4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn13Q9Z0S4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn13Q9Z0S4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn13Q9Z0S4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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