Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp4Q9WV89 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms