Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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