Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

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Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vav3Q9R0C8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vav3Q9R0C8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vav3Q9R0C8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav3Q9R0C8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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