Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcamQ9R069 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms