Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Col4a4Q9QZR9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Col4a4Q9QZR9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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