Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms