Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Gpc1Q9QZF2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gpc1Q9QZF2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gpc1Q9QZF2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gpc1Q9QZF2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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