Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnt3Q9QZ47 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms