Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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