Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms