Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Limd1Q9QXD8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Limd1Q9QXD8 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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