Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms