Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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