Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms