Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scamp5Q9JKD3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms