Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms