Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc17Q9ESX4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc17Q9ESX4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc17Q9ESX4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc17Q9ESX4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc17Q9ESX4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc17Q9ESX4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc17Q9ESX4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms