Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms