Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER04

Tmprss5, Transmembrane protease serine 5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss5Q9ER04 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmprss5Q9ER04 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms