Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms