Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Tlr1Q9EPQ1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tlr1Q9EPQ1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tlr1Q9EPQ1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tlr1Q9EPQ1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tlr1Q9EPQ1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tlr1Q9EPQ1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tlr1Q9EPQ1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tlr1Q9EPQ1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tlr1Q9EPQ1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tlr1Q9EPQ1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tlr1Q9EPQ1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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