Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms