Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms