Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms