Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms