Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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