Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cyp2c55Q9D816 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms