Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms