Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms