Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Zcchc13Q9D548 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms