Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms