Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms