Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Syce1Q9D495 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Syce1Q9D495 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Syce1Q9D495 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Syce1Q9D495 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Syce1Q9D495 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Syce1Q9D495 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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