Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UvssaQ9D479 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms