Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms