Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms