Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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