Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gins3Q9CY94 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gins3Q9CY94 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gins3Q9CY94 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms