Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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