Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl11Q9CXW4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl11Q9CXW4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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